Биоинформатика поможет создавать новые антибактериальные препараты

Биоинформатика поможет создавать новые антибактериальные препараты

Из генома человеческих комменсальных микроорганизмов были выделены участки, кодирующие малые молекулы. Одной из них оказалась молекула тиопептида, вещества, сходного с антибактериальным препаратом, который в настоящее время изучается в клинических исследованиях. Авторы рассматривают свою биоинформационную методику как новый путь создания новых лекарственных средств и способ изучения микробиома.

Исследователи из Университета Калифорнии в Сан-Франциско создали самообучающийся алгоритм, при помощи которого в геноме выделялись кластеры биосинтетических генов, кодирующих малые молекулы. Они применили его для анализа генетической информации комменсальных бактерий человека. В микробиоме было выделено 3118 кластеров. Были представлены все семейства малых молекул, в том числе сложные поликетиды и нерибосомальные пептиды. Все это указывает на огромный потенциал к созданию новых антибактериальных препаратов. Еще одно важное применение методики состоит в изучении взаимодействия микроорганизмов между собой и с организмом хозяина. Практически все эти взаимодействия опосредованы малыми молекулами. Таким образом, можно будет понять, как микробиом влияет на состояние организма человека.

В ходе работы было обнаружено, что одна из молекул, продуцируемых комменсальными микроорганизмами, сходна с изучаемым в настоящее время антибактериальным препаратом группы тиопептидов. Эта молекула, лактоциллин, была выделена из важного представителя флоры влагалища — Lactobacillus gasseri. Была показана ее активность в отношении грамм-положительных патогенов, и было доказано, что она секретируется бактериями in vivo. Препараты, содержащие лактоциллин, можно применять, например, при кожных инфекциях, вызванных Staphylococcus aureus.

В исследовании впервые был проведен активный поиск потенциальных лекарственных молекул в микробиоме человека, и была отработана методика изучения взаимодействий микроорганизмов.

Самые свежие новости медицины в нашей группе на Одноклассниках
Читайте также

Оставить комментарий

Вы можете использовать HTML теги: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>

Time limit is exhausted. Please reload the CAPTCHA.